答案：
B
【解析】
草履虫是单细胞的动物，整个身体由一个细胞构成，生活在水中，通过一个细胞可以完成营养、呼吸、排泄、运动、生殖和调节等各项生命活动。
A.草履虫整个身体由一个细胞构成，属于单细胞生物，A正确；
B.草履虫通过表膜进行呼吸，但草履虫整个身体由一个细胞构成，因此不具有器官这个结构，表膜是它的细胞膜，B错误；
C.实验时，由于培养液的表层含氧丰富，草履虫大多积聚在表层，因此应从培养液的上层吸取草履虫，C正确；
D.由于草履虫有纤毛，能够在水中旋转前进，导致显微镜下不容易看清其内部结构，因此在载玻片的液滴上放几丝棉花纤维的目的是限制草履虫的运动，D正确。
故选：B。